Günay Ekberli 2008 yılında Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesinden mezun oldu. Ankara Dışkapı Çocuk Sağlığı ve Hastalıklar Hematoloji ve Onkoloji Hastanesinde 2015 yılında Çocuk Cerrahisi, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Cocuk Ürolojisi Bilim Dalında 2019 yılında Çocuk Ürolojisi ihtisasını tamamladı. 2020 yılında Avrupa Çocuk Ürolojisi Yeterlilik sınavına girerek FEAPU ünvanını aldı. 2023 yılında Doçentlik ünvanını aldı. 2020-2024 yılları arasında Adana Şehir Hastanesinde Çocuk Ürolojisi hekimi olarak görev yaptı. Ankara Bilkent Şehir Hastanesi Çocuk Ürolojisi kliniğinde 2024 senesi itibari ile görev doktor öğretim üyesi olarak görev yapmaya başlamıştır.